中央氣象局地震測報中心主任郭鎧紋說，造成這次地震的肇因是南投縣仁愛鄉的盲斷層，這條斷層在地底深處，尚未破裂到地表。
郭鎧紋說，目前這條盲斷層已經愈來愈明顯，在九二一大地震後，仁愛鄉盲斷層曾經發生過芮氏規模6.8的地震，今年3月27日也發生過規模6.2地震。
他表示，這個盲斷層預估有數十公里長，但可能未達100公里，如果斷層破裂達100公里，有機率發生規模7以上的地震。
郭鎧紋指出，因為這條斷層屬於未露出地表的盲斷層，依目前國內的儀器和科技，還沒有能力完整描繪出斷層線的確實位置，但經由多次的地震，可獲得相當的資訊。
根據經濟部中央地質調查所統計，台灣共有33條活動斷層，另有4條「存疑性斷層」未列入編號。
郭鎧紋表示，北部較知名斷層包括金山斷層、山腳斷層；中部有屯子腳斷層、車籠埔斷層；西南部有梅山斷層、新化斷層；南部有旗山斷層、潮州斷層；東部有米崙斷層和池上斷層等。
氣象局地震測報中心表示，以釋放能量來比喻，二次大戰在廣島原爆的原子彈為單位，這次仁愛鄉地震釋放的能量為1.4顆原子彈，約為是九二一大地震釋放能量的1/33。

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一顆約2.7公里寬的巨大小行星已掠過地球，這顆1998 QE2小行星在台北時間6月1日凌晨4時59分到達最接近地球的位置。
1998 QE2這次掠過地球的距離，是至少未來兩世紀小行星掠過地球的最近距離，「僅」580萬公里遠。儘管如此，這個距離仍是地球與月球距離的15倍左右。
研究人員說，1998 QE2沒有撞擊風險。這對人類來說是好消息，因為科學家認為，任何大於0.9公里的小行星撞上地球就足以毀滅人類文明。
科學家密切關注1998 QE2，試圖進一步了解這顆小行星的特性和運行軌道。例如，無線天文學團隊剛利用美國國家航空暨太空總署（NASA）加州金石（Goldstone）深太空通訊網，發現這顆小行星為雙星系統，有1顆約600公尺寬的衛星繞行。
NASA說，研究人員會在金石和波多黎各的阿雷西沃天文台（Arecibo Observatory）繼續觀察1998 QE2，直至9日為止。

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